雙孢菇、草菇輪作栽培可以提高原料利用率，同時也使菇房常年不閑，提高土地產出率。秋、冬、春季種植雙孢菇，每平方米種植面積可出菇12～15千克，夏季輪作種植草菇，每平方米可出菇5～8千克。
雙孢菇栽培
1.時間安排。雙孢菇栽培主要是利用自然氣溫進行生產，一般進行秋播，8月初開始建堆發酵，10月中下旬開始采收，12月秋菇采收結束，至次年3月氣溫回升，又可出菇，至5月春菇結束。
2.培養料配制（以100平方米菇棚計算）。
配方1：麥秸2000千克，牛糞1500千克，菜籽餅50千克，尿素5千克，硫酸銨10千克，碳酸鈣40千克，過磷酸鈣1千克，石膏粉10千克。
配方2：麥秸2000千克，牛糞1000千克，菜籽餅50千克，尿素8千克，硫酸銨2千克，碳酸鈣40千克，過磷酸鈣2千克，石膏粉15千克。其中，麥秸要求無霉變、金黃色且稈多葉少，牛糞要求是黃褐色的粉碎的干牛糞。
3.建堆發酵。過程：原料（麥秸）預濕→建堆→翻堆。采用二次發酵法。室外第1次發酵時間25天左右，翻堆5次，間隔時間分別是7天、6天、5天、4天、3天。預濕時注意將麥秸預濕透，可以建堆2～3天，常向堆內噴水，建堆時以先草后糞的順序層層加高堆制。按照寬1.6～2米、高1.6～1.8米的規格，長度根據場所而定。添加的化肥大部分在建堆時加入，至少加入總量的50％，邊建堆邊噴水，建完堆后有水滲出堆外即可。晴天用草被皮覆蓋，雨天用塑料薄膜覆蓋，嚴防雨水淋入。
雨后及時掀開薄膜通氣。翻堆宜在堆溫達最高后開始下降時進行。翻堆時，視堆料的干濕度酌情加水，并且第1次翻堆時把所需添加的化肥全部加入。測試堆溫時應將溫度計放入好氧發酵區。發酵結束后的培養料應當是秸稈平扁、柔軟、呈現咖啡色、手一拉即斷，具特有的香味。
棚內進行第2次發酵。將堆料移入菇房，堆在層架上，用蒸氣加溫，讓過熱的蒸氣通入菇房，在1～2天內房溫升到57～60℃，維持6～8小時后降到48～52℃，維持4～6天。其目的在于利用高溫殺死大部分害蟲卵和病、雜菌孢子，并利用高溫在菇房中改善供氧情況下再次發酵，增加料中營養。
4.菇房的消毒滅菌。前茬草菇收獲之后，清出廢料，并用濃石灰水或波爾多液徹底消毒，以防將雜菌帶入下茬。將適度腐熟的培養料先填入最上層床架，從上到下，逐床填入，填料厚度為16～20厘米。填料完畢，即關閉門窗，用甲醛或硫黃粉熏蒸消毒24小時，操作方法與空菇房消毒相同。
5.鋪料、播種。菇房熏蒸消毒后，打開門窗及排風筒，排除藥液氣味或熱氣，及時翻料。若培養料偏濕或料內氨氣過濃，在料面噴2％～3％甲醛溶液，隨后密閉1夜，次日打開門窗通風后再翻料1次。播種前需先測量料溫，若溫度超過30℃，可再翻料1次降溫，待培養料溫度下降至28℃以下時才可播種。提前掰碎菌種，把2/3的菌種撒在料面上，翻入料的一半深處，再將料面整平、整勻，余下的1/3菌種撒在料面上，然后保持濕度，并控制溫度不高于28℃，進行菌絲培養。
6.覆土與催菇管理。當菌絲長入料內2/3時，即可覆土。覆土前要把料面抹勻拍平。要選毛細孔多、有機質含量高、團粒結構好、持水量大，且含有一定的營養成分的土壤作覆土材料，以利于雙孢菇菌絲穿透泥層生長。覆土厚度一般為2.5～3厘米，菇房每平方米床面約需粗土35千克，摻入生石灰，拌勻，調整至含水量60％、pH值8.0時覆蓋。覆土后第2天開始噴水，使料吸足水分。經過10～12天，菌絲可長至離土表面0.5～1厘米處，此時應噴重水并加強通風，進行催菇。一般覆土后約經20天可見小菇出現，以后便進入出菇管理。
7.出菇管理。當雙孢菇菇帽直徑長到3～4厘米時及時采收，以防開傘或者降低商品性。采摘時用手捏住上部，輕輕旋轉扭下，不能破壞土層，1潮菇可采收7天左右，秋菇期間一般可收4批，秋菇產量占總產量的70％左右。出菇完畢，便開始清理菇房和準備下輪草菇生產。
草菇栽培
1.時間安排。從雙孢菇收獲到雙孢菇料進棚，有5個月左右的空閑期，此時正值暑夏，適宜栽培草菇。一般從6月中旬麥收后及時備料，建堆發酵，至8月中旬收菇完畢。
2.培養料配制。配方：麥草92％、麥麩5％、干牛糞1％、磷肥1％、石膏1％，并準備占干料4％的生石灰，根據栽培經驗不宜加尿素，否則易生雜菌菇。
3.麥草發酵與消毒。將麥草用濃度為3％的石灰水浸泡24小時，使其吃透水并變軟，然后加入牛糞、石膏、磷肥等，與麥草拌勻，做寬1.5米、高1米、長度不限的料堆，堆底留通風道，堆頂覆蓋薄膜保濕、保溫，進行發酵，當堆溫上升到60℃時，保持24小時，再建堆，堆高1米、寬1米、長度不限。建堆后補足水分。
4.鋪床、播種。發酵后的麥草鋪在床面上形成中心高、周邊低的龜背形，中心料厚20厘米，周邊厚15厘米，上面撒麥麩（經2％石灰水浸泡）和石灰粉，噴足水，使含水量達到75％左右、pH值在9.0～10.0之間。當料溫穩定于40℃以下、無氨味時播種。每平方米播500克菌種，采用穴播法播一半菌種，剩余的另一半菌種播到菌床培養料的表面，并用木板壓實，使菌種與料緊貼。
5.覆土及發菌管理。覆土：取荒坡草叢下的壤土，經太陽暴曬后備用，播后隨即在床面上覆土0.8～1厘米厚，并噴石灰水使覆土含水量達到最大，但不漏水到培養料中，調整pH值到8.0～9.0之間。然后關閉部分通風口，保持空氣相對濕度90％左右、溫度35℃左右進行發菌。若棚內溫度升高，需加厚覆蓋物，早晚打開通風口，并可于溝內灌水和中午在棚頂覆蓋物上噴水降溫，確保棚內溫度不超過38℃，若料內水分不足，可噴石灰水補充。經過9天左右菌絲便會長滿培養料，開始現幼菇。
6.出菇管理與采收。出現針頭大小的幼菇后，應保持空氣相對濕度在85％～95％之間。幼菇期不能直接向菇體噴水，隨著菇體長大，為保持濕度，可每天向空中噴霧2次，向菇床噴水時，要使水溫與床溫相近，盡量不要直接噴到菇體上。到草菇伸長期及時采收，第1潮菇采收后，停止噴水3天，第4天噴重水，為第2潮菇提供充足的水分。經過3個潮次就基本出菇完畢，便可出料準備雙孢菇生產。
